Das Hauptinteresse von Jörn Schmidt liegt im Bereich der Fischerei und momentan auch darüberhinausgehend in der generellen Frage nach der Nachhaltigkeit der Ozeane.

Spezielle Forschungsfragen sind:

• Wie kann sich die Fischerei-Begutachtung und das -Management von einem Einzelarten-, zum Mehrarten- und letztendlich zum Ökosystem-Ansatz entwickeln?
• Wie kann Wissenschaft an Interessenvertreter vermittelt werden und Forschungsfragen zusammen mit Interessenvertretern entwickelt werden?
• Wie können innovative Instrumente, z.B. Spiele für Unterrichts-und Kommunikationszwecke genutzt werden?
• Was sind die Hauptcharakteristika von gekoppelten Modellen und dem Rahmen, in dem sie angewendet werden, wenn sie für eine praktische Beratung genutzt werden sollen?